39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4450 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  32.1 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  29.63 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  29.63 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  29.17 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  30.49 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  30.49 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  29.63 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  25.58 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  25.58 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  29.7 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  28.4 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  27 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  29.89 
 
 		 102 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>