36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3690 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  215  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  32.95 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  32.56 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  32.56 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  29.07 
 
 		 277 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  26.14 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  28.41 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>