24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0731 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  59.38 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  26.51 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>