40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0843 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  89.62 
 
 		 111 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 112 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  46.74 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  48.51 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  42.27 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  43.42 
 
 		 277 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  38.14 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  39.29 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  32.43 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  36.11 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  34.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  35.38 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>