71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2770 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 115 aa  229  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  50.47 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  45.45 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  47 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  41.84 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  37.78 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  44.58 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  46.88 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  44.12 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  40.82 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  35.56 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  39.53 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  39.53 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  36.11 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0795  hypothetical protein  47.37 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0281  hypothetical protein  45.61 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  38.16 
 
 		 277 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  32.88 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  32.1 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  29 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  32.1 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  32.88 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  33.8 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  26.73 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  37 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  26 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2004  hypothetical protein  36.92 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>