47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1135 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 114 aa  224  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1137  hypothetical protein  84.91 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  53.01 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  46.24 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  43.02 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  32.63 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  32.61 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  31.87 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  32.14 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  37.21 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  37.21 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  32.26 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  35.06 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  30.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  31.88 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  31.88 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>