71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1046 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4482  hypothetical protein  77.17 
 
 		 148 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1187  hypothetical protein  52.8 
 
 		 137 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  64.2 
 
 		 109 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 109 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3925  hypothetical protein  34.71 
 
 		 146 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2908  hypothetical protein  36.94 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1494  hypothetical protein  37.29 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.566835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0634  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0207  hypothetical protein  32.46 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.335071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1860  hypothetical protein  32.79 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3800  hypothetical protein  32.77 
 
 		 127 aa  72  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.92452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0246  hypothetical protein  34.92 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 107 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0271  hypothetical protein  34.92 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0556  hypothetical protein  35.11 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2609  hypothetical protein  35.83 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2470  hypothetical protein  35.83 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0716803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0905  hypothetical protein  35.83 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2253  hypothetical protein  36.97 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  0.0981277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2856  hypothetical protein  35.59 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3740  hypothetical protein  36.97 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298391  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5566  hypothetical protein  36.97 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2369  hypothetical protein  34.13 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7074  hypothetical protein  33.59 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00681904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4398  hypothetical protein  33.9 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0862516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6814  hypothetical protein  35.59 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0340512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 111 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4521  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3684  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439114  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3843  hypothetical protein  36.13 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  44 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4901  hypothetical protein  35.29 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0916616  hitchhiker  0.000097555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26270  hypothetical protein  36.04 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784361  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1570  hypothetical protein  34.29 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1420  hypothetical protein  34.29 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5937  hypothetical protein  30.95 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805677  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 113 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 111 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4081  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 109 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0436  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.888364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2379  hypothetical protein  32.76 
 
 		 152 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2862  hypothetical protein  29.46 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.927887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0031  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.829328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 94 aa  52.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0458  hypothetical protein  33.64 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2111  hypothetical protein  33.64 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 115 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 109 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 111 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 91 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3065  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2226  hypothetical protein  29.69 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 108 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3485  hypothetical protein  25.95 
 
 		 137 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0944759 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3583  hypothetical protein  26.55 
 
 		 136 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 114 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 86 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1814  hypothetical protein  30.84 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000108382  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2010  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00777804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 105 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>