39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0723 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  97.27 
 
 
110 aa  219  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  71.96 
 
 
137 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  56.48 
 
 
113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  56.48 
 
 
113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  56.48 
 
 
113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  56.48 
 
 
113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  52.83 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  39.66 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  39.66 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 
93 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  32.31 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 
92 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  41.38 
 
 
93 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
89 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  26.8 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  31.65 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  31.65 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  41.51 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  25.51 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 
109 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  34.48 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>