59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3000 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  98.96 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  55.81 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  55.81 
 
 		 93 aa  105  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  55.42 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  52.33 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  52.33 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  49.38 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  43.02 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  42.68 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27820  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  48.61 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  36.14 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  40.74 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  35.82 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  30.95 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  30.95 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  32.81 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1887  hypothetical protein  52.78 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  32.76 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  28.17 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 114 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  25.76 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>