28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0997 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  196  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  59.38 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  41.24 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  30.86 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  31.96 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  31.96 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>