50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3340 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  234  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  73.83 
 
 		 107 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 107 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  71.76 
 
 		 102 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 91 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  53.27 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  45.63 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  41.58 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  41.25 
 
 		 277 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  29.67 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  32.22 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  29.55 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  34.12 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  34.12 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  30.59 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  35.48 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  32.43 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 90 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  31.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  31.34 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1137  hypothetical protein  36.73 
 
 		 100 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>