72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3587 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
105 aa  207  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  59.18 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  54.17 
 
 
115 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  50.59 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
112 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  47.67 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  51.11 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  47.19 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  44.21 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 
112 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  45.35 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  45 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  46.53 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  43.43 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  49.18 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0795  hypothetical protein  42.47 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0281  hypothetical protein  42.47 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  43.94 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  46.77 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  37.65 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  36.99 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  35.62 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 
112 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  34.25 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  34.15 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1137  hypothetical protein  40.38 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532665  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  34.44 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  37.74 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  32.95 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  32.95 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5325  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.307634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  30.95 
 
 
277 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  36.23 
 
 
72 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  29 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  37.25 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2004  hypothetical protein  32.43 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.174278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  37.68 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  39.58 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0390  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.945426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>