17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3466 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 90 aa  183  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  73.26 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  41.77 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 115 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 94 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>