48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4238 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
113 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
113 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  96.46 
 
 
113 aa  228  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  96.46 
 
 
113 aa  228  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  56.25 
 
 
137 aa  137  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  56.48 
 
 
110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  56.07 
 
 
110 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  54.95 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  34 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  34 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  35.82 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  34.21 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  28.28 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  30.1 
 
 
109 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  31.43 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  31.43 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  34.21 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  31.25 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  31.94 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  29.13 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  28.71 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>