66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_D2814 on replicon NC_007617
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  69.09 
 
 		 111 aa  167  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 111 aa  160  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  43.16 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  46.73 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  45.26 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  42.48 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  39.74 
 
 		 277 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  32.18 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  32.18 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  35.23 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  32.22 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  35.29 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  28.17 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  32.81 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  38.36 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  30.88 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  30.88 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  32.39 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  29.79 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 93 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1137  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>