21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2925 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  207  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  44.58 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  30.95 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  29.81 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>