43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0402 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  45.56 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  39.81 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  34 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  36.96 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  33.7 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  32.14 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  32.61 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  34.52 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  30.95 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 109 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 109 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  31.96 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  27.14 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>