15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6342 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  73.26 
 
 		 90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  44.87 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  34.72 
 
 		 277 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>