25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0069 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 111 aa  85.5  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  39.33 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  36 
 
 		 277 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>