56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3517 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  81.72 
 
 		 93 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  78.49 
 
 		 93 aa  154  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  77.42 
 
 		 93 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  75.82 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  81.4 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  70.97 
 
 		 93 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 93 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 93 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 93 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  58.7 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  52.69 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  52.33 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  52.33 
 
 		 96 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27820  hypothetical protein  58.14 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  54.76 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  50.7 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  43.21 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1887  hypothetical protein  65.22 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  38.1 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  44.68 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  36.9 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  35.21 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  33.73 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  27.78 
 
 		 91 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5345  hypothetical protein  60.61 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>