26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_27820  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  187  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  55.81 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  53.41 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  53.49 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  55.17 
 
 		 93 aa  94.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  53.49 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 93 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 93 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 93 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 93 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  52.33 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  45.05 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  43.75 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  43.75 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  37.76 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  35.06 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5345  hypothetical protein  70 
 
 		 57 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>