25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1558 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  193  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  72.53 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  40.96 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  39.02 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  36.9 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  36.59 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  36.59 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27820  hypothetical protein  37.76 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  31.03 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  32.31 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>