66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2419 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  92.23 
 
 		 103 aa  194  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  57 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  49.51 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  49.51 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  44.66 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  43.3 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  45.05 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  45.35 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  44 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  44 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  42.35 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  36.11 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  38.37 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  38.82 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  39.42 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  39.42 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  35 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1722  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 204 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  31.37 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  31.33 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  30.39 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 136 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>