75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3280 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  91.58 
 
 		 95 aa  173  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  88.42 
 
 		 95 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  61.63 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  62.07 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 		 99 aa  90.1  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  49.43 
 
 		 94 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  48.84 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  48.84 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  43.96 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  40 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2896  hypothetical protein  76.19 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  42.39 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  37.36 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  37.36 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  43.37 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  37.63 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  33.33 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  38.54 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  39.36 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  35.16 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  35.16 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  31.46 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  31.58 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  29.21 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 104 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>