13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  729    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  53.22 
 
 		 388 aa  358  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  50.78 
 
 		 509 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  25.5 
 
 		 565 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 474 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.71 
 
 		 432 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 488 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1039 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  26.2 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>