20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1281 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1281  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 419 aa  820    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.525264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1987  helix-turn-helix domain-containing protein  49.36 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00401079  normal  0.325189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4024  transcriptional regulator, XRE family  44.05 
 
 		 483 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0917395  hitchhiker  0.00196902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  36.71 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 282 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  33.78 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  30.85 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  28.57 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  26.07 
 
 		 497 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.67 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  26.72 
 
 		 530 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 460 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  29.33 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>