15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1067 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1067  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  945    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.119168  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 
449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  25.33 
 
 
412 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4914  hypothetical protein  41.86 
 
 
279 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172157  hitchhiker  0.00523873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  28.66 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  28.94 
 
 
526 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  26.3 
 
 
487 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 
530 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  35.43 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.48 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  34.02 
 
 
510 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  35.51 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  39.19 
 
 
460 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>