224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2338 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 82 aa  167  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  59.21 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  59.04 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  57.69 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  45.07 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  42.17 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  42.47 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  42.42 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  47.06 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  47.06 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 74 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  37.88 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  40.35 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  43.33 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  40 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  32.26 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  32.5 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 390 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 85 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  42.11 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  56 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>