24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4607 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  724    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  44.14 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  38.3 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  35.71 
 
 		 411 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  34.02 
 
 		 418 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  37.28 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  36.15 
 
 		 514 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  27.35 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 457 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  28.12 
 
 		 484 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  28.93 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.39 
 
 		 418 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  28 
 
 		 503 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 441 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 488 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  25.41 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  30.81 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  25.94 
 
 		 537 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  38.2 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  38.2 
 
 		 455 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  37.5 
 
 		 444 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>