21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1672 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 442 aa  882    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 431 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  33.11 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  31.17 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  30.84 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  25.95 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  27.8 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  24.82 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  43.04 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  44.9 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  30.51 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  31.12 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  27.57 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  29.63 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  42.11 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  27.73 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  31.71 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  27.97 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  29.17 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>