21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4654 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 
431 aa  851    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  59.4 
 
 
455 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  50.46 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  44.53 
 
 
429 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  50.76 
 
 
320 aa  255  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  48.93 
 
 
320 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  37.56 
 
 
444 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  38.25 
 
 
444 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
442 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  31.38 
 
 
439 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  56.25 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3627  hypothetical protein  49.22 
 
 
128 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  28.97 
 
 
556 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  26.07 
 
 
545 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  27.63 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  51.67 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  31.86 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  38.2 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  25.71 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  32.14 
 
 
461 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  27.59 
 
 
470 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>