78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3931 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3931  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4136  transcriptional regulator, XRE family  44.02 
 
 		 259 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1542  transcriptional regulator, XRE family  42.02 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2309  transcriptional regulator, XRE family  37.89 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  39.91 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  32.11 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  25.79 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.05 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  32.14 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  28.34 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  23.74 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  28.8 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  31.93 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.55 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  22.98 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.65 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.81 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  29.95 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  28.93 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  27.27 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  24.87 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1128  hypothetical protein  29.17 
 
 		 102 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00280699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  29.11 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  27.2 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  28.35 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2127  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  27.23 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  26.22 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  28.02 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  30.8 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.09 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3240  transcriptional regulator, XRE family  27.14 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  27.75 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  26.4 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 81 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  30.89 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  29.75 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  28.07 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  27.27 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  25.23 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6705  helix-turn-helix domain protein  29.6 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.19 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  31.9 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  28.07 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 94 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  26.99 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  25.11 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 286 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  24.87 
 
 		 284 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  31.71 
 
 		 143 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  23.85 
 
 		 291 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  24.69 
 
 		 264 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>