133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1089 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4136  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1542  transcriptional regulator, XRE family  39.92 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2309  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3931  transcriptional regulator, XRE family  39.91 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  27.82 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  27.53 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.4 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  30.56 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  27.61 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  27.88 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  27.61 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  27.31 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.13 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  31.09 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  28.05 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  27.41 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  30.46 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1128  hypothetical protein  37.25 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00280699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  32.83 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  24.79 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  25.46 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  32.48 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  25.65 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  23.64 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  31.55 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  25.21 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.45 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.94 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  26.11 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  26.22 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  24.73 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  31.37 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6457  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0109923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  29.25 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.37 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  26.27 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  33.59 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  33.14 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  30.86 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  30.13 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  27.01 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  26.42 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  26.3 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  29.09 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  30.41 
 
 		 301 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.82 
 
 		 287 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 410 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.27 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  26.78 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  26.05 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  31.55 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  26.64 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3365  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  30 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  24.9 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 287 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  24.06 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.37 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  25.86 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  25.46 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.47 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  24.63 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  32.86 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  29.29 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  31.21 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  31.67 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  22.05 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  23.08 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3779  transcriptional regulator, XRE family  25.21 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  35.23 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  25.93 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>