147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6457 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6457  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 175 aa  351  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0109923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  40.69 
 
 		 277 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  74.51 
 
 		 217 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  37.3 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  38.19 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.81 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  36.29 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  37.41 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.82 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  32.65 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.11 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  27.45 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  30.92 
 
 		 291 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  32.8 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 274 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  29.2 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.17 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  28.28 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  32.64 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  30.5 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.89 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  27.33 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.41 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.01 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  27.21 
 
 		 302 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 301 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  63.04 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  32.59 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 279 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  30.43 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  25.97 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1089  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  27.34 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  27.46 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.5 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  26.8 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  26.8 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  30.41 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  32.82 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  28.38 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  23.81 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  35.83 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  33.08 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  30.5 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  27.21 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  28.67 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  25.32 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  51.72 
 
 		 255 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  24.18 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  26.17 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  30 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1128  hypothetical protein  36.67 
 
 		 102 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00280699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  51.72 
 
 		 255 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 326 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  28.86 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  58.7 
 
 		 255 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 		 314 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 		 267 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 268 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 296 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  26.49 
 
 		 293 aa  51.2  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  28.47 
 
 		 283 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1294  helix-turn-helix domain protein  30.89 
 
 		 290 aa  50.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  27.69 
 
 		 303 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  25.9 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  27.63 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  29.66 
 
 		 276 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0292  XRE family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 278 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  27.59 
 
 		 282 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  27.48 
 
 		 299 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  27.59 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5909  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 285 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 282 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  31.11 
 
 		 284 aa  47.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.39 
 
 		 278 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  25.4 
 
 		 301 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  26.43 
 
 		 281 aa  47.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>