151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1294 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1294  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2091  hypothetical protein  38.08 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2376  helix-turn-helix domain protein  31.8 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6363  hypothetical protein  29.55 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0272477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0020  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.36 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  27.45 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0292  XRE family transcriptional regulator  29 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4643  helix-turn-helix domain protein  28.36 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  30.8 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0021  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  28.68 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  30.53 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4524  hypothetical protein  35.98 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  27.73 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.29 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  28.14 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2127  helix-turn-helix domain protein  29.38 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  28.79 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1597  XRE family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3646  helix-turn-helix domain protein  28.14 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  31.37 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  28.79 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  30.69 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1837  helix-turn-helix domain protein  26.36 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.92 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  28.68 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  29.26 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20570  Helix-turn-helix protein  32.16 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.936379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  27.45 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  26.44 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  25.95 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  28.62 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  29.88 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  27.6 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  25.45 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  27.7 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  34.57 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  25.51 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.26 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  26.01 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6705  helix-turn-helix domain protein  30.63 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  30.05 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  25.69 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  26.8 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  27.1 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  23.32 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  24.26 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  30.81 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  25.27 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  27.8 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1905  putative regulatory protein  31.48 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  31.48 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  27.51 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3240  transcriptional regulator, XRE family  32.8 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  29.14 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  26.07 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  27.21 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  26.32 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  26.49 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  29.52 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.67 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  31.97 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  31.19 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  25.81 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  26.05 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  29.56 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  30.41 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.41 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  25.82 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  26.46 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  30.31 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>