157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1597 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1597  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2376  helix-turn-helix domain protein  44.78 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6363  hypothetical protein  35.36 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0272477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4643  helix-turn-helix domain protein  38.32 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2091  hypothetical protein  31.01 
 
 		 253 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0021  transcriptional regulator, XRE family  33.74 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  30.4 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  25.8 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0020  transcriptional regulator, XRE family  27.65 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  27.21 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.76 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0292  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  25.99 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  32.56 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  28.46 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1906  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.43 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  25.59 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  30.09 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  27.76 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 410 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.74 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  27.8 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  25.35 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  27.86 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4524  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.71 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  30.86 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.52 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  26.3 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  25.81 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  26.18 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  26.26 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1905  putative regulatory protein  34.26 
 
 		 141 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  27.3 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  28.92 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  25.53 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  24.48 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  25.1 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.8 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  26.1 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  27.4 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  24.28 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  27.2 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  25.72 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  25.54 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  25.45 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  31.03 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  29.11 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  26.74 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  29.89 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  24.53 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  25.34 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0084  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  26.26 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  23.43 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  25.62 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  26.69 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  29.17 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  33.01 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  26.82 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  27.2 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  22.74 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  34.91 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.73 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  26.12 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  24.91 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4490  transcriptional regulator, XRE family  24.25 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2091  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  25.76 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  24.31 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>