14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1905 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1905  putative regulatory protein  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6363  hypothetical protein  37.82 
 
 		 283 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0272477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 282 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1597  XRE family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 282 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4524  hypothetical protein  33.87 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2376  helix-turn-helix domain protein  29.17 
 
 		 282 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4643  helix-turn-helix domain protein  29.23 
 
 		 273 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2091  hypothetical protein  24.27 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  28.33 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0292  XRE family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1294  helix-turn-helix domain protein  31.48 
 
 		 290 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0020  transcriptional regulator, XRE family  24.39 
 
 		 291 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0021  transcriptional regulator, XRE family  33.01 
 
 		 298 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>