176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2127 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2127  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  32.58 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  32.45 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  35.07 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  35.5 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  34.36 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  33.58 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  31.97 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  32.96 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  32.12 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  34.82 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  32.25 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.47 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.03 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  31.06 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  39.17 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  30.62 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  31.5 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  32.87 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  31.64 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  35.81 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  33.65 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.66 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  33.74 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  35.2 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  32.09 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.35 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  31.2 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  29.56 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.74 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  31.75 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.63 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  31.54 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  31.91 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.1 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  31.37 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  34.3 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  29.66 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  36.23 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  31.01 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  32.39 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 410 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  34.95 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.39 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  30.19 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  32.74 
 
 		 326 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7002  transcriptional regulator, XRE family  27.86 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  27.09 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  30.04 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  29.59 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  32.37 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  33.72 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  32.79 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  30.43 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 276 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  29.75 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6705  helix-turn-helix domain protein  28.67 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  27.01 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  29.3 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  32.25 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  32.74 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.23 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.12 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  30.15 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  28.78 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  27.14 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  28.52 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  29.84 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.2 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  31.25 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.75 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  29.15 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>