More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2458 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  63.24 
 
 		 72 aa  91.7  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 72 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6741  putative transcriptional regulator  64 
 
 		 58 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0202746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  37.31 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  31.88 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  35 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  34.48 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.87 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  35.09 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2992  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.169879  hitchhiker  0.00733208 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 528 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  34.38 
 
 		 196 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  30.51 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>