55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2505 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  58.41 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2004  hypothetical protein  36.28 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  35.62 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  35.29 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 322 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 288 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.81 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6091  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4529  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  47.5 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0154  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 134 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 287 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 66 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  33.93 
 
 		 303 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  23.71 
 
 		 292 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4834  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 		 285 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  23 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  36.67 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  25.77 
 
 		 288 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 282 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 69 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2262  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 293 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.827528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 198 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>