41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0070 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
52 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  94.23 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  92.31 
 
 
67 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  90.38 
 
 
67 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  90.38 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  90.38 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  90.38 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  90.38 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  90.38 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  90.38 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  90.38 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  64.71 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  64.71 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 
106 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 
175 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  40 
 
 
302 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 
252 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  38 
 
 
308 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 
374 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
1143 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 
505 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  40.43 
 
 
359 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  38.78 
 
 
459 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 
255 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  34.78 
 
 
49 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 
84 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
250 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 
130 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
87 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>