211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2264 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2264  conjugal transfer protein TrbA  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000287063  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0046  conjugal transfer protein TrbA  64.96 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91014  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6591  conjugal transfer protein TrbA  69.75 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000102889  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6501  conjugal transfer protein TrbA  69.75 
 
 		 120 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000173415  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4275  conjugal transfer protein TrbA  68.91 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  6.75879e-22  normal  0.733184 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  39.06 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 252 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  42.62 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  38.24 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  38.24 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  38.24 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  46 
 
 		 215 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 256 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  38.24 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  38.24 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  38.24 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 489 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  42.31 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  36.76 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  48.89 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 490 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 255 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 232 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  29.41 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  47.83 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  34.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  42.65 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  40.62 
 
 		 489 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 227 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>