188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1401 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  35.29 
 
 		 347 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3125  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 279 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0971  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.508784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1041  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1168  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.092853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  31 
 
 		 342 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2160  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1563  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  36.67 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4834  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2456  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.20041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  31.82 
 
 		 303 aa  47  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  35 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 308 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  28.95 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.29 
 
 		 401 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3305  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875341  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3628  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422451  normal  0.286276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  32.32 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 289 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 244 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4093  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4413  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 252 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0753  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.057083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 198 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 219 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3038  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 219 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 219 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5734  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0155  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  28.87 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  30.16 
 
 		 370 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.35 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3505  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0016  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0154  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>