49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0095 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  36.3 
 
 		 386 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  28.38 
 
 		 347 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  25.94 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  27.56 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  26.29 
 
 		 355 aa  72  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  23.85 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  26.6 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  27.23 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  24.12 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.11 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  24.51 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  22.17 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  24.76 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  26.71 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.47 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  24.54 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  27.07 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  27.46 
 
 		 378 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  20.98 
 
 		 352 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  27.71 
 
 		 370 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  22.41 
 
 		 363 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.29 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  28.57 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  26.36 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  23.44 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  26.85 
 
 		 356 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  25.27 
 
 		 372 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  25.69 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  21.55 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  23.12 
 
 		 362 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  24.28 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  26.05 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  24.12 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  22.62 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  27.01 
 
 		 357 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  24.24 
 
 		 399 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  25.28 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 366 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  23.25 
 
 		 365 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25.58 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  24.4 
 
 		 391 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  24.4 
 
 		 391 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  23.83 
 
 		 399 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>