14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4066 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  27.67 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  31.48 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  28.76 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7697  hypothetical protein  25.17 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  36.59 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  38.46 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  28.16 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28.04 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.46 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  27.64 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  22.46 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>