37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2566 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  590  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7697  hypothetical protein  38.55 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  33.1 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  30 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  27.97 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  39.36 
 
 		 174 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  26.62 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  29.92 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  36 
 
 		 171 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  32.79 
 
 		 157 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1145  hypothetical protein  29.03 
 
 		 146 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000142865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  32.43 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  32.43 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5400  hypothetical protein  35.64 
 
 		 355 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  31.86 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  27.4 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  27.4 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  42.86 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  44.07 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  27.81 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  26.01 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.47 
 
 		 165 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  31.25 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  32.47 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  38.46 
 
 		 168 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  31.85 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 370 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  29.31 
 
 		 177 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  28.16 
 
 		 352 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>