61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1586 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  100 
 
 
129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  42.86 
 
 
394 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  36.67 
 
 
355 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  51.67 
 
 
416 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  41.3 
 
 
351 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  35.77 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  27.35 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  34 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  27.92 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  35.38 
 
 
362 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  33.93 
 
 
302 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  37.63 
 
 
346 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  43.88 
 
 
372 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  32.71 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  41.18 
 
 
352 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  45.45 
 
 
366 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  35.79 
 
 
375 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  40.91 
 
 
360 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  44.07 
 
 
359 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  27.27 
 
 
272 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  31.86 
 
 
285 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  30.65 
 
 
349 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  27.81 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  35.9 
 
 
365 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  48.08 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  48.08 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  48.08 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  27.52 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3077  protein of unknown function DUF955  38.98 
 
 
196 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  31.4 
 
 
215 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.65 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  29.58 
 
 
251 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0781  hypothetical protein  29.17 
 
 
232 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  34 
 
 
400 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  37.63 
 
 
370 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  38.98 
 
 
395 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  46 
 
 
356 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  34.48 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  46.43 
 
 
404 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  30.5 
 
 
295 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2128  protein of unknown function DUF955  37.17 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.607652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  28.77 
 
 
173 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  29.17 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  29.41 
 
 
255 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
370 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  27.37 
 
 
146 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 
352 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  27.68 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 
372 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  31.03 
 
 
269 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  32.23 
 
 
216 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 
366 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  24.18 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  36.47 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  33.71 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  35.37 
 
 
270 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  55.26 
 
 
372 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  32.39 
 
 
336 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  42.55 
 
 
370 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  30.61 
 
 
367 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  29.41 
 
 
171 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>