35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2459 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  44.63 
 
 
153 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3017  hypothetical protein  37.58 
 
 
175 aa  93.6  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  45.3 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  45.3 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  45.3 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0823  protein of unknown function DUF955  46.67 
 
 
147 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  39.29 
 
 
142 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  41.74 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  41.74 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  39.26 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  40.91 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0019  hypothetical protein  37.04 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0297  hypothetical protein  38.62 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.301247  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0260  protein of unknown function DUF955  40.74 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3927  protein of unknown function DUF955  36.59 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5810  hypothetical protein  38.74 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1020  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000136149  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  31.03 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2970  hypothetical protein  36.94 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0485  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192781  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0696  protein of unknown function DUF955  28.97 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1145  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000142865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2435  prophage LambdaBa01, repressor protein, putative  31.82 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000773608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  30.83 
 
 
174 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2270  protein of unknown function DUF955  31.37 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.412653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  27.05 
 
 
362 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  32.46 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  42.86 
 
 
257 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  35.29 
 
 
346 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  34.29 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.18 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  27.37 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  30.53 
 
 
147 aa  40.8  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>