25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1020 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1020  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000136149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  42.11 
 
 
142 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  38.35 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  39.1 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  39.1 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2970  hypothetical protein  29.92 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284014  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5810  hypothetical protein  35.64 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  36.11 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  31.34 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  31.34 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  31.34 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0823  protein of unknown function DUF955  32.17 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0260  protein of unknown function DUF955  31.03 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0019  hypothetical protein  27.91 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  26.62 
 
 
272 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0297  hypothetical protein  26.43 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.301247  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  27.54 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  31.96 
 
 
357 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3927  protein of unknown function DUF955  28.18 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  24.65 
 
 
269 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  29.35 
 
 
346 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  30.1 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  27.2 
 
 
283 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>