28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0222 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  100 
 
 
179 aa  370  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  31.03 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  29.37 
 
 
142 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0260  protein of unknown function DUF955  33.65 
 
 
136 aa  60.5  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  31.47 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  27.41 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3017  hypothetical protein  27.04 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  27.41 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  27.41 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  31.3 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  25.19 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  30.1 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2970  hypothetical protein  34.17 
 
 
141 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284014  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0823  protein of unknown function DUF955  29.46 
 
 
147 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1020  hypothetical protein  27.54 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000136149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  25.47 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3927  protein of unknown function DUF955  33.59 
 
 
136 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  25.37 
 
 
355 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2435  prophage LambdaBa01, repressor protein, putative  29.55 
 
 
91 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000773608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.49 
 
 
394 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  25.56 
 
 
355 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 
356 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  25.89 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  28.89 
 
 
399 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1145  hypothetical protein  25.19 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000142865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  32.43 
 
 
382 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 
386 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>